项目文章|DDX56通过miRNAs调节转录后Wnt信号并与鳞癌早期复发相关

题目：DDX56 modulates post-transcriptional Wnt signaling through miRNAs and is associated with early recurrence in squamous cell lung carcinoma.

期刊：Molecular Cancer

影响因子：15.302

发表时间：2021 Aug 26

平台：iTRAQ标记定量蛋白组；Affymetrix Human U133 Plus 2.0 Array；Agilent Human miRNA (8 × 60 K) Microarray（mRNA及miRNA芯片服务由伯豪提供）

早期复发是鳞状细胞肺癌(SqCLC)延长术后生存的主要障碍。SqCLC早期复发的分子机制尚不清楚，需要有效的预后生物标志物来预测早期复发。来自复旦大学肿瘤医院的陈海泉教授和中科院生物化学与细胞生物学研究所曾嵘研究员为共同通讯作者在Molecular Cancer发表题为“DDX56 modulates post-transcriptional Wnt signaling through miRNAs and is associated with early recurrence in squamous cell lung carcinoma”的研究，发现DDX56在经历早期和晚期疾病复发的患者的肿瘤中表达增加。DDX56转录后促进多个Wnt信号通路相关基因的表达，包括CTNNB1、WNT2B，并抑制一组miRNAs，包括已知的Wnt信号抑制剂miR-378a-3p。详细分析表明，DDX56促进了原代miR-378a的降解，导致成熟miR-378a-3p的下调，从而降低了目的基因WNT2B的表达。该研究中的表达谱芯片相关服务由伯豪提供，下面我们一起来具体学习这篇新鲜出炉的多组学联合分析文章。

结果

1. 筛选与切除后SqCLC复发时间相关的差异表达蛋白

利用标记定量蛋白组 iTRAQ 在原发性手术后早期复发(ER，< 10个月)和晚期复发(LR，>30个月)患者原发性SqCLC肿瘤组织进行差异表达蛋白质筛选。在SqCLC肿瘤中ER与LR中下调的蛋白主要与免疫应答有关，而上调的蛋白主要参与RNA修饰，其中上调的蛋白DDX56还未在SqCLC肿瘤报道。

2. DDX56高表达与SqCLC患者预后不良相关

在独立的SqCLC队列中，DDX56在SqCLC肿瘤中的高表达随后被证实是一个独立的无复发生存率差的预后因素。并在公共数集中验证发现DDX56在SqCLC和其它癌症预后都显著相关。

在功能上，DDX56在体外促进SqCLC细胞的生长和迁移，在体内促进异种移植瘤的发展；机制上，DDX56转录后促进多个Wnt信号通路相关基因的表达，包括CTNNB1、WNT2B，并抑制一组miRNAs，包括已知的Wnt信号抑制剂miR-378a-3p。生信分析和验证实验表明DDX56促进了原代miR-378a的降解，导致成熟miR-378a-3p的下调，从而降低了目的基因WNT2B的表达。

作者的研究表明，DDX56在ER和匹配的LR患者之间的差异表达只在肿瘤组织中观察到，而在IHC不表达或弱表达DDX56的邻近正常组织中没有观察到。这意味着DDX56表达的增加是受肿瘤特异性调控的。最近，几种通过与DDX3ATP结合域或RNA结合位点结合来抑制DDX3的化合物的抗癌性能已被研究，这为DDX56也可能成为小分子靶点并用于治疗SqCLC带来了希望。

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